Atua procurando assegurar a implementação do planejamento global, anual e plurianual da FUNAI, desenvolvendo as atividades de orçamento, modernização administrativa, contabilidade e de finanças.

A área de Orçamento age elaborando, orientando e consolidando as propostas orçamentárias, os planos de aplicação de programas especiais e dotações globais, elaborando e consolidando os cronogramas de desembolso, prestando serviços de orientação técnica às unidades descentralizadas da FUNAI, acompanhando e avaliando o desempenho do sistema de orçamento.

A área de Modernização Administrativa exerce as atividades de ajuste dos métodos e processos de administração à eficiência e eficácia da FUNAI, de formulação de diretrizes e normas de organização com vistas a otimização de ações, bem como de desenvolvimento de estudos visando à atualização das estruturas organizacionais e, especificamente: de desenvolvimento, implantação, avaliação e montagem dos procedimentos administrativos dos sistemas de informação em articulação com o Departamento de Informática; de orientação na elaboração de formulários e de desenho técnico publicitário, gráfico e artístico; e de desenvolvimento de estudos destinados ao contínuo aperfeiçoamento da FUNAI e de promoção de reformulação de suas estruturas, normas, sistemas e métodos em articulação com o órgão setorial de modernização e informática doMinistério da Justiça.

A área de Contabilidade atua recebendo, conferindo e emitindo parecer sobre prestação de contas de suprimento de fundos, mantendo registro dos ordenadores de despesas, elaborando tomadas de contas especiais, procedendo a conciliação das contas bancárias; preparando a prestação de contas anual; recebendo e conferindo os documentos de ordem contábil, executando os lançamentos de baixa e transferência patrimonial, elaborando balancetes mensal e o balanço geral; mantendo o controle dos instrumentos firmados, acompanhando o andamento dos serviços contratados e elaborando, sempre que necessário, relatórios físico - financeiros.

A área de Finanças age realizando, registrando e acompanhando a execução orçamentária da FUNAI, controlando os saldos de pessoal e da administração central, promovendo o repasse dos créditos orçamentário e financeiro às unidades descentralizadas, acompanhando e controlando a utilização do Sistema Integrado de Administração Financeira - SIAFI; registrando, controlando, classificando e analisando as receitas, elaborando o cronograma de desembolso da administração central, registrando e controlando as contas bancárias sob sua responsabilidade.